Về cách đánh số thứ tự đối với văn bản là Thông tư và Thông tư liên tịch: Thông tư và Thông tư liên tịch được xác định là hai hình thức văn bản khác nhau (có ký hiệu về hình thức khác nhau), có sự phân biệt theo quy định của Luật Ban hành văn bản quy phạm pháp luật và Thông tư số 25/2011/TT-BTP ngày 27/12/2011 của Bộ Tư pháp hướng dẫn về thể thức, kỹ thuật trình bày văn bản quy phạm pháp luật của Chính phủ, Thủ tướng Chính phủ, Bộ trưởng, Thủ trưởng cơ quan ngang Bộ và văn bản quy phạm pháp luật liên tịch; do đó, việc đánh số thứ tự của hai loại văn bản này được đăng ký, ghi số thứ tự tại văn thư là khác nhau (tách riêng, có phân biệt). Như vậy, số thứ tự của văn bản quy định chi tiết, hướng dẫn thi hành là Thông tư và Thông tư liên tịch được ghi bằng chữ số Ả Rập, theo thứ tự về thời gian ban hành đối với mỗi hình thức văn bản, bắt đầu từ số 1.
Tuy nhiên, theo Luật Ban hành văn bản quy phạm pháp luật thì Thông tư và Thông tư liên tịch là cùng loại Thông tư và do cùng cấp ban hành, cùng giá trị pháp lý nên việc sắp xếp các điều trong 02 loại Thông tư này được thực hiện theo trật tự từ văn bản ban hành trước đến văn bản ban hành sau.